Endogamia é um sistema em que os acasalamentos se dão entre indivíduos aparentados, relacionados pela ascendência, ou seja, é a união de indivíduos mais aparentados do que a média da população.
Tem como efeito genético a diminuição da heterozigose e o aumento da homozigose, e, como efeito fenotípico, uma grande manifestação de genes recessivos, que acabam resultando em perda de vigor, assim como a perda da variância, à medida que aumenta o parentesco.
Endogamia pode estar estabelecida em grupos sociais, áreas ou relações. Vários tipos de endogamia foram observados em populações humanas, tal como:
Endogamia de aldeia (por exemplo, nos Ianomâmis)
Endogamia de linhagem (por exemplo, em comunidades pastorais do Médio Oriente)
Endogamia de castas (por exemplo, na Índia)
Endogamia de classes (por exemplo, nos Estados Unidos)
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